ceRNA

Huang M, Zhong Z, Lv M, Shu J, Tian Q, Chen J. Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in bladder carcinoma. Oncotarget. 2016;7(30):47186-47200

A:  ceRNA网络在胃癌中的表达。B: 萤光素酶验证得出FER1L4与miR-106a-5p之间的直接相互作用。

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案例一 癌症研究—lncRNA在癌症中的转录后调节作用

 

一些长的非编码RNA(lncRNA)通过充当竞争性内源RNA(ceRNA)而在调节基因表达中起重要作用。然而,lncRNA相关的ceRNA在肿瘤发生中的作用还不完全清楚。在此基础上,利用胃癌lncRNA芯片数据,生物信息学算法miRcode和microRNA(miRNA)以TarBase数据库为目标,首先构建了lncRNA-miRNA-mRNA网络。然后,通过头颈部鳞状细胞癌,前列腺癌,乳头状甲状腺癌,垂体性腺瘤,卵巢癌和慢性淋巴细胞白血病等六种其他癌症的数据证实了这一点。结果清楚的显示癌症相关的ceRNA网络。此外,细胞实验结果表明,FER1L4-小干扰RNA(siRNA)同时抑制FER1L4和RB1mRNA水平。这些结果表明lncRNA具有MREs并且在癌症中的转录后调节中起重要作用。

案例分析

A:  ceRNA网络在胃癌中的表达。B: 萤光素酶验证得出FER1L4与miR-106a-5p之间的直接相互作用。

案例二 癌症研究—lncRNAs和circRNAs与膀胱癌的发病机制和发展

 

越来越多的证据表明长的非编码RNA(lncRNAs)和环状RNAs(circRNAs)在肿瘤发生中起重要作用。然而,这些机制在很大程度上仍然未知为了研究lncRNA和circRNAs在膀胱癌中的表达谱及其生物学功能,本研究通过进行膀胱癌和癌旁组织的lncRNA / circRNA和mRNA表达谱检测、定量实时PCR、GO和KEGG途径富集分析、编码非编码共表达(CNC),竞争性内源RNA(ceRNA),顺式调控,lncRNAs转录因子(TF)mRNA等相关表达网络等分析,结果表明lncRNAs和circRNAs可能牵涉膀胱癌的发病机制和发展。本研究结果为lncRNAs和circRNAs提供了一个新的视角,为未来研究lncRNAs和circRNA在膀胱癌中的潜在作用奠定了基础。

Xia T, Liao Q, Jiang X, Shao Y, Xiao B, Xi Y, Guo J. Long noncoding RNA associated-competing endogenous RNAs in gastric cancer. Sci Rep. 2014 Aug 15;4:6088. doi: 10.1038/srep06088. PubMed PMID: 25124853; PubMed Central PMCID: PMC4133709.